Entre sus películas más importantes figura Jules y Jim (1962), donde su personaje encarna el romanticismo y la contradicción con una naturalidad difícil de igualar; y Fahrenheit 451 (1966), en la que interpreta a Montag dentro de una distopía marcada por la censura y la uniformidad cultural. En el terreno del thriller político y de espionaje, sobresale El espía que surgió del frío (1965), una de las aproximaciones más sobrias y desencantadas a la Guerra Fría en el cine, con Werner aportando tensión psicológica y ambigüedad moral.

Su prestigio internacional se consolidó también con El barco de los locos (1965), interpretación que le valió una nominación al Óscar y que lo situó en el centro del cine anglosajón de la época. Completan el núcleo esencial de su carrera Decisión al amanecer (1951), drama bélico de espionaje que muestra su fuerza interpretativa en registros tempranos; Lola Montes (1955), hito del cine europeo de gran producción; y Las sandalias del pescador (1968), donde su presencia contribuye al tono solemne y reflexivo del relato. En conjunto, estas obras explican por qué Werner sigue ocupando un lugar preferente en cualquier aproximación seria al cine clásico europeo y a sus cruces con Hollywood.